Ce nouveau cours de Biologie sur 2 ans est proposé par le Département de Biologie de la Faculté des Sciences de Luminy, pour les étudiants des
autres disciplines scientifiques (Informatique, Mathématiques et Physique).
Cette année ce cours sera suivi par des étudiants d'Informatique et de Mathématiques.
Voici le programme du cours : (aussi
sur le serveur du Département de Bio
)
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Rappel des cours de Licence : (1,5 heures)
- Fonctionnement de la cellule
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Structure et fonction des protéines: différentes catégories de protéines (enzymes, facteurs de transcription,
récepteurs, structurelles, etc.). (2 heures)
- Méthodes d étude des protéines: purification, cristallographie pour la
structure, utilisation des anticorps pour montrer la présence de protéines dans une cellule. (3 heures)
- Métabolisme de
la cellule: production d énergie (ATP); rapport catabolisme/ anabolisme; métabolisme des lipides et production des
membranes. Mécanismes enzymatiques. (3 heures)
- Le tri des protéines: comment assurer qu'une protéine est dirigée vers
le noyau ou vers la reticulum endoplasmique (2 heures)
- Signalisation: quelles sont des molécules qui assurent la
passage de l information de cellule à cellule. Importance pour le développement et la différenciation des tissus. (3
heures)
- La physiologie d'organisme (4h)
Les organismes proviennent d'une seule cellule. Leur multiplication et leur différentiation s'accompagnent d'une spécialisation
qui aboutit à leur adaptation et leur rôle spécifique dans l'organisme. Les cellules sont rassemblées en un ensemble fonctionnel :
un organe. Les organes qui participent à la même fonction constituent un système.
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introduction à la physiologie et adaptation aux conditions extrêmes (2h)
- le système immunitaire (2h)
- La régulation de l'expression de l'information génétique
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Les mécanismes moléculaires qui assurent qu'un
organisme peut déclencher l'expression d'un gène dans une type de cellule et pas dans toutes les cellules à un moment
précis. Interaction entre les facteurs de transcription. Mécanismes qui contrôlent l'activité des facteurs de
transcription. (2 heures)
- L'épissage différentiel comme méthode pour changer le patron d'expression des protéines sans
changer la transcription. (1 heure)
- Régulation au niveau traductionnel: l'idée d'une demi-vie pour un ARN (stabilité
des transcrits). (2 heures)
- Les méthodes de transgénèse et de KO : mouche, souris.(3 heures)
- Bioinformatique (2h cours, 4h TP, 4h TD)
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L'un des objectifs récurrents de la bioinformatique consiste à mettre en évidence des motifs fonctionnels dans les séquences des
macromolécules biologiques (ADN, ARN, protéines). Cette thématique sera introduite en se réferant au problème des sites d'ADN reconnus par
les facteurs de régulation transcriptionnelle. Les principales méthodes de découverte et de recherche de motifs seront introduites en
cours, pour être sensuite appliquées en TP. Pour compléter ce panorama, les TD porteront sur l'analyse d'articles récents qui prennent en
compte l'organisation des sites de régulation en modules ou leur conservation relative au cours de l'évolution.
- TP (mouillés)
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Western blotting, gels d'acrylamide,
anti-corps
- Northern blot.
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Responsable :
Dominique Charmot |
Correspondant Info :
Elisabeth Godbert
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Correspondant Maths :
Pascal Hubert
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Enseignants :
Francis Blasco
Dominique Charmot
Keith Dudley
Michel Fougereau
Frank Galland
Simone Granon
Bruno Hivert
Isabelle Le Brun
D. Martin
Christophe Robaglia
Denis Thieffry
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| L'examen sera sous forme orale, avec éventuellement des compte-rendus de TP à rendre |
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